东南大学是我国国际交流与合作最为活跃的高校之一。截至2023年末，学校已基本建成世界一流（高水平）大学国际合作网络，共与来自20个国家或地区的50余所世界一流大学和高水平研究机构建立了紧密的合作关系，包括美国麻省理工学院、加州大学伯克利分校、宾夕法尼亚大学，加拿大不列颠哥伦比亚大学、多伦多大学，英国剑桥大学、帝国理工大学、爱丁堡大学、伯明翰大学，瑞士苏黎世理工，瑞典皇家理工学院，德国慕尼黑工业大学，法国巴黎高科，新加坡国立大学、南洋理工大学，澳大利亚蒙纳士大学，日本大阪大学、东京工业大学等。2017年，东南大学发起成立了“中英大学工程教育与研究联盟”，是中国与英国合作建立的首个以工程教育与研究为特色的大学联盟。2021年，东南大学与英国伯明翰大学联合发起成立“碳中和世界大学联盟”，成为全球首个聚焦碳中和领域技术发展和人才培养的世界大学联盟。学校还与澳大利亚蒙纳士大学合作建立了东南大学—蒙纳士大学苏州联合研究生院，是教育部批准的首个中外联合研究生院；与法国雷恩一大合作建立了东南大学—雷恩一大研究生学院。东南大学正以“全球高端、实质合作、引领发展”为方向，加快形成全方位、有重点、多层次、宽领域、高水平的国际交流合作格局。